Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NfiaQ02780 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
NfiaQ02780 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NfiaQ02780 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NfiaQ02780 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NfiaQ02780 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NfiaQ02780 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
NfiaQ02780 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NfiaQ02780 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NfiaQ02780 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NfiaQ02780 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NfiaQ02780 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NfiaQ02780 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NfiaQ02780 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
NfiaQ02780 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
NfiaQ02780 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NfiaQ02780 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
NfiaQ02780 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
NfiaQ02780 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NfiaQ02780 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NfiaQ02780 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NfiaQ02780 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
NfiaQ02780 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NfiaQ02780 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NfiaQ02780 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NfiaQ02780 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
NfiaQ02780 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NfiaQ02780 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NfiaQ02780 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
NfiaQ02780 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
NfiaQ02780 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NfiaQ02780 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NfiaQ02780 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
NfiaQ02780 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
NfiaQ02780 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
NfiaQ02780 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
NfiaQ02780 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
NfiaQ02780 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
NfiaQ02780 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
NfiaQ02780 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NfiaQ02780 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
NfiaQ02780 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
NfiaQ02780 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NfiaQ02780 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
NfiaQ02780 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
NfiaQ02780 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NfiaQ02780 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NfiaQ02780 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
NfiaQ02780 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NfiaQ02780 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NfiaQ02780 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
NfiaQ02780 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NfiaQ02780 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
NfiaQ02780 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
NfiaQ02780 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NfiaQ02780 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
NfiaQ02780 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
NfiaQ02780 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
NfiaQ02780 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
NfiaQ02780 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
NfiaQ02780 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
NfiaQ02780 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
NfiaQ02780 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
NfiaQ02780 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
NfiaQ02780 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
NfiaQ02780 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
NfiaQ02780 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
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NfiaQ02780 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
NfiaQ02780 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
NfiaQ02780 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
NfiaQ02780 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
NfiaQ02780 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
NfiaQ02780 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
NfiaQ02780 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
NfiaQ02780 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
NfiaQ02780 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
NfiaQ02780 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
NfiaQ02780 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
NfiaQ02780 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
NfiaQ02780 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
NfiaQ02780 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
NfiaQ02780 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
NfiaQ02780 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
NfiaQ02780 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
NfiaQ02780 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
NfiaQ02780 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
NfiaQ02780 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
NfiaQ02780 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
NfiaQ02780 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
NfiaQ02780 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
NfiaQ02780 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
NfiaQ02780 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
NfiaQ02780 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
NfiaQ02780 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
NfiaQ02780 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
NfiaQ02780 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
NfiaQ02780 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
NfiaQ02780 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
NfiaQ02780 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
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