Protein–RNA interactions for Protein: Q01887

Ryk, Tyrosine-protein kinase RYK, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RykQ01887 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
RykQ01887 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
RykQ01887 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
RykQ01887 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
RykQ01887 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
RykQ01887 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
RykQ01887 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
RykQ01887 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
RykQ01887 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
RykQ01887 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
RykQ01887 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
RykQ01887 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
RykQ01887 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
RykQ01887 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
RykQ01887 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
RykQ01887 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
RykQ01887 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
RykQ01887 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
RykQ01887 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
RykQ01887 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
RykQ01887 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
RykQ01887 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
RykQ01887 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
RykQ01887 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
RykQ01887 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
RykQ01887 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
RykQ01887 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
RykQ01887 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
RykQ01887 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
RykQ01887 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
RykQ01887 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
RykQ01887 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
RykQ01887 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC12.02□□□□□ -0.48
RykQ01887 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
RykQ01887 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
RykQ01887 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
RykQ01887 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
RykQ01887 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
RykQ01887 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
RykQ01887 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
RykQ01887 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
RykQ01887 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
RykQ01887 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
RykQ01887 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
RykQ01887 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
RykQ01887 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
RykQ01887 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
RykQ01887 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
RykQ01887 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
RykQ01887 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
RykQ01887 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
RykQ01887 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
RykQ01887 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
RykQ01887 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
RykQ01887 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
RykQ01887 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
RykQ01887 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
RykQ01887 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
RykQ01887 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
RykQ01887 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
RykQ01887 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
RykQ01887 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
RykQ01887 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
RykQ01887 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
RykQ01887 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
RykQ01887 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
RykQ01887 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
RykQ01887 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
RykQ01887 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
RykQ01887 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
RykQ01887 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
RykQ01887 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
RykQ01887 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
RykQ01887 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
RykQ01887 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
RykQ01887 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
RykQ01887 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
RykQ01887 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
RykQ01887 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
RykQ01887 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
RykQ01887 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
RykQ01887 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
RykQ01887 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
RykQ01887 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
RykQ01887 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
RykQ01887 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
RykQ01887 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
RykQ01887 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
RykQ01887 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
RykQ01887 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
RykQ01887 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
RykQ01887 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
RykQ01887 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
RykQ01887 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
RykQ01887 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
RykQ01887 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
RykQ01887 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
RykQ01887 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
RykQ01887 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
RykQ01887 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms