Protein–RNA interactions for Protein: Q01727

Mc1r, Melanocyte-stimulating hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc1rQ01727 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Mc1rQ01727 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Mc1rQ01727 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Mc1rQ01727 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Mc1rQ01727 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Mc1rQ01727 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Mc1rQ01727 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Mc1rQ01727 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Mc1rQ01727 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Mc1rQ01727 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Mc1rQ01727 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Mc1rQ01727 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Mc1rQ01727 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Mc1rQ01727 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Mc1rQ01727 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Mc1rQ01727 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Mc1rQ01727 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Mc1rQ01727 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Mc1rQ01727 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Mc1rQ01727 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Mc1rQ01727 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Mc1rQ01727 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Mc1rQ01727 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Mc1rQ01727 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Mc1rQ01727 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Mc1rQ01727 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Mc1rQ01727 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Mc1rQ01727 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Mc1rQ01727 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Mc1rQ01727 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Mc1rQ01727 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Mc1rQ01727 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Mc1rQ01727 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Mc1rQ01727 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Mc1rQ01727 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Mc1rQ01727 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Mc1rQ01727 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Mc1rQ01727 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Mc1rQ01727 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Mc1rQ01727 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Mc1rQ01727 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Mc1rQ01727 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Mc1rQ01727 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Mc1rQ01727 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Mc1rQ01727 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Mc1rQ01727 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Mc1rQ01727 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Mc1rQ01727 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Mc1rQ01727 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Mc1rQ01727 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Mc1rQ01727 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Mc1rQ01727 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Mc1rQ01727 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Mc1rQ01727 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Mc1rQ01727 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Mc1rQ01727 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Mc1rQ01727 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Mc1rQ01727 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Mc1rQ01727 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Mc1rQ01727 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Mc1rQ01727 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Mc1rQ01727 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Mc1rQ01727 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Mc1rQ01727 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Mc1rQ01727 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Mc1rQ01727 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Mc1rQ01727 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Mc1rQ01727 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Mc1rQ01727 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Mc1rQ01727 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Mc1rQ01727 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Mc1rQ01727 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Mc1rQ01727 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Mc1rQ01727 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Mc1rQ01727 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Mc1rQ01727 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Mc1rQ01727 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Mc1rQ01727 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Mc1rQ01727 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Mc1rQ01727 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Mc1rQ01727 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Mc1rQ01727 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Mc1rQ01727 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Mc1rQ01727 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mc1rQ01727 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mc1rQ01727 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mc1rQ01727 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mc1rQ01727 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mc1rQ01727 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mc1rQ01727 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mc1rQ01727 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mc1rQ01727 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mc1rQ01727 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mc1rQ01727 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mc1rQ01727 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mc1rQ01727 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mc1rQ01727 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mc1rQ01727 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Mc1rQ01727 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mc1rQ01727 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.2 ms