Protein–RNA interactions for Protein: Q01279

Egfr, Epidermal growth factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EgfrQ01279 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EgfrQ01279 Gm16347-202ENSMUST00000149000 772 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EgfrQ01279 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
EgfrQ01279 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EgfrQ01279 Tlx1-202ENSMUST00000174617 806 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EgfrQ01279 Gm8492-201ENSMUST00000182375 987 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
EgfrQ01279 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EgfrQ01279 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
EgfrQ01279 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
EgfrQ01279 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
EgfrQ01279 Gm45460-201ENSMUST00000211385 1038 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EgfrQ01279 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
EgfrQ01279 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EgfrQ01279 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
EgfrQ01279 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EgfrQ01279 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
EgfrQ01279 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EgfrQ01279 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EgfrQ01279 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EgfrQ01279 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
EgfrQ01279 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EgfrQ01279 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EgfrQ01279 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
EgfrQ01279 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
EgfrQ01279 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
EgfrQ01279 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
EgfrQ01279 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
EgfrQ01279 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
EgfrQ01279 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
EgfrQ01279 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
EgfrQ01279 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EgfrQ01279 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EgfrQ01279 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EgfrQ01279 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EgfrQ01279 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
EgfrQ01279 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EgfrQ01279 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EgfrQ01279 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
EgfrQ01279 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EgfrQ01279 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EgfrQ01279 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EgfrQ01279 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EgfrQ01279 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EgfrQ01279 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EgfrQ01279 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EgfrQ01279 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EgfrQ01279 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EgfrQ01279 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EgfrQ01279 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EgfrQ01279 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EgfrQ01279 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EgfrQ01279 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EgfrQ01279 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EgfrQ01279 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EgfrQ01279 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EgfrQ01279 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EgfrQ01279 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EgfrQ01279 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EgfrQ01279 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
EgfrQ01279 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EgfrQ01279 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EgfrQ01279 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EgfrQ01279 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EgfrQ01279 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EgfrQ01279 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EgfrQ01279 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EgfrQ01279 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EgfrQ01279 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EgfrQ01279 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EgfrQ01279 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EgfrQ01279 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EgfrQ01279 Gm23153-201ENSMUST00000175323 313 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
EgfrQ01279 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EgfrQ01279 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EgfrQ01279 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
EgfrQ01279 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
EgfrQ01279 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
EgfrQ01279 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EgfrQ01279 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EgfrQ01279 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
EgfrQ01279 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EgfrQ01279 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EgfrQ01279 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EgfrQ01279 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EgfrQ01279 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EgfrQ01279 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EgfrQ01279 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EgfrQ01279 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
EgfrQ01279 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EgfrQ01279 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EgfrQ01279 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
EgfrQ01279 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EgfrQ01279 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EgfrQ01279 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EgfrQ01279 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EgfrQ01279 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EgfrQ01279 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EgfrQ01279 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EgfrQ01279 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EgfrQ01279 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms