Protein–RNA interactions for Protein: Q00286

Pou1f1, Pituitary-specific positive transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou1f1Q00286 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Pou1f1Q00286 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pou1f1Q00286 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Pou1f1Q00286 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pou1f1Q00286 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pou1f1Q00286 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pou1f1Q00286 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pou1f1Q00286 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Pou1f1Q00286 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pou1f1Q00286 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pou1f1Q00286 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pou1f1Q00286 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pou1f1Q00286 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pou1f1Q00286 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pou1f1Q00286 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pou1f1Q00286 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pou1f1Q00286 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pou1f1Q00286 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pou1f1Q00286 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pou1f1Q00286 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pou1f1Q00286 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pou1f1Q00286 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pou1f1Q00286 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pou1f1Q00286 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Pou1f1Q00286 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pou1f1Q00286 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pou1f1Q00286 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pou1f1Q00286 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pou1f1Q00286 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pou1f1Q00286 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Pou1f1Q00286 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pou1f1Q00286 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pou1f1Q00286 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pou1f1Q00286 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Pou1f1Q00286 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pou1f1Q00286 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pou1f1Q00286 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pou1f1Q00286 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pou1f1Q00286 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pou1f1Q00286 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pou1f1Q00286 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pou1f1Q00286 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pou1f1Q00286 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pou1f1Q00286 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pou1f1Q00286 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pou1f1Q00286 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pou1f1Q00286 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pou1f1Q00286 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pou1f1Q00286 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pou1f1Q00286 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pou1f1Q00286 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pou1f1Q00286 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Pou1f1Q00286 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Pou1f1Q00286 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pou1f1Q00286 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pou1f1Q00286 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Pou1f1Q00286 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Pou1f1Q00286 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Pou1f1Q00286 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pou1f1Q00286 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pou1f1Q00286 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pou1f1Q00286 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pou1f1Q00286 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pou1f1Q00286 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pou1f1Q00286 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pou1f1Q00286 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pou1f1Q00286 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pou1f1Q00286 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pou1f1Q00286 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pou1f1Q00286 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pou1f1Q00286 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pou1f1Q00286 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pou1f1Q00286 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pou1f1Q00286 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pou1f1Q00286 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pou1f1Q00286 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pou1f1Q00286 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pou1f1Q00286 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pou1f1Q00286 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pou1f1Q00286 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pou1f1Q00286 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Pou1f1Q00286 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pou1f1Q00286 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Pou1f1Q00286 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pou1f1Q00286 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pou1f1Q00286 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pou1f1Q00286 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms