Protein–RNA interactions for Protein: P97793

Alk, ALK tyrosine kinase receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AlkP97793 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AlkP97793 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AlkP97793 Rmdn1-202ENSMUST00000108253 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AlkP97793 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AlkP97793 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AlkP97793 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
AlkP97793 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
AlkP97793 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AlkP97793 Gm8492-201ENSMUST00000182375 987 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
AlkP97793 Gm35822-201ENSMUST00000204954 562 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
AlkP97793 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AlkP97793 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AlkP97793 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
AlkP97793 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
AlkP97793 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
AlkP97793 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
AlkP97793 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
AlkP97793 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
AlkP97793 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
AlkP97793 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
AlkP97793 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
AlkP97793 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
AlkP97793 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
AlkP97793 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
AlkP97793 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
AlkP97793 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
AlkP97793 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
AlkP97793 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
AlkP97793 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
AlkP97793 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
AlkP97793 Isl1-202ENSMUST00000176044 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
AlkP97793 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
AlkP97793 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
AlkP97793 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
AlkP97793 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
AlkP97793 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
AlkP97793 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
AlkP97793 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
AlkP97793 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
AlkP97793 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AlkP97793 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
AlkP97793 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AlkP97793 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AlkP97793 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
AlkP97793 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
AlkP97793 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
AlkP97793 Gm3671-201ENSMUST00000182463 1007 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
AlkP97793 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
AlkP97793 Snu13-202ENSMUST00000080622 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AlkP97793 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
AlkP97793 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AlkP97793 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AlkP97793 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AlkP97793 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
AlkP97793 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AlkP97793 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AlkP97793 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AlkP97793 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
AlkP97793 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AlkP97793 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AlkP97793 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
AlkP97793 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AlkP97793 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AlkP97793 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AlkP97793 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AlkP97793 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
AlkP97793 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AlkP97793 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
AlkP97793 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
AlkP97793 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AlkP97793 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AlkP97793 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AlkP97793 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AlkP97793 Dclk1-215ENSMUST00000200352 1662 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
AlkP97793 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AlkP97793 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
AlkP97793 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AlkP97793 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AlkP97793 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AlkP97793 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
AlkP97793 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AlkP97793 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AlkP97793 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AlkP97793 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AlkP97793 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AlkP97793 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AlkP97793 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
AlkP97793 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AlkP97793 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
AlkP97793 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
AlkP97793 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AlkP97793 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AlkP97793 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AlkP97793 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AlkP97793 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AlkP97793 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
AlkP97793 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AlkP97793 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AlkP97793 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AlkP97793 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms