Protein–RNA interactions for Protein: P97370

Atp1b3, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b3P97370 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp1b3P97370 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp1b3P97370 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp1b3P97370 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp1b3P97370 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp1b3P97370 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp1b3P97370 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp1b3P97370 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp1b3P97370 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp1b3P97370 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp1b3P97370 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp1b3P97370 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp1b3P97370 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp1b3P97370 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp1b3P97370 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp1b3P97370 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp1b3P97370 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp1b3P97370 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp1b3P97370 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp1b3P97370 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp1b3P97370 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp1b3P97370 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp1b3P97370 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp1b3P97370 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp1b3P97370 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp1b3P97370 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp1b3P97370 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp1b3P97370 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp1b3P97370 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp1b3P97370 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp1b3P97370 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp1b3P97370 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp1b3P97370 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp1b3P97370 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp1b3P97370 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp1b3P97370 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp1b3P97370 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp1b3P97370 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp1b3P97370 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp1b3P97370 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Atp1b3P97370 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Atp1b3P97370 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Atp1b3P97370 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Atp1b3P97370 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Atp1b3P97370 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp1b3P97370 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp1b3P97370 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp1b3P97370 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp1b3P97370 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp1b3P97370 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp1b3P97370 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp1b3P97370 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp1b3P97370 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp1b3P97370 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp1b3P97370 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp1b3P97370 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp1b3P97370 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp1b3P97370 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp1b3P97370 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp1b3P97370 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp1b3P97370 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp1b3P97370 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp1b3P97370 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp1b3P97370 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp1b3P97370 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp1b3P97370 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp1b3P97370 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp1b3P97370 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp1b3P97370 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp1b3P97370 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp1b3P97370 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp1b3P97370 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp1b3P97370 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp1b3P97370 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp1b3P97370 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp1b3P97370 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp1b3P97370 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp1b3P97370 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp1b3P97370 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp1b3P97370 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp1b3P97370 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp1b3P97370 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp1b3P97370 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp1b3P97370 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp1b3P97370 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp1b3P97370 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp1b3P97370 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp1b3P97370 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp1b3P97370 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp1b3P97370 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp1b3P97370 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp1b3P97370 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp1b3P97370 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp1b3P97370 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp1b3P97370 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp1b3P97370 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp1b3P97370 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp1b3P97370 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp1b3P97370 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp1b3P97370 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104.6 ms