Protein–RNA interactions for Protein: P81067

Irx3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx3P81067 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Irx3P81067 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Irx3P81067 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Irx3P81067 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Irx3P81067 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Irx3P81067 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Irx3P81067 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Irx3P81067 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Irx3P81067 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Irx3P81067 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Irx3P81067 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Irx3P81067 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Irx3P81067 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Irx3P81067 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Irx3P81067 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Irx3P81067 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Irx3P81067 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Irx3P81067 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Irx3P81067 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Irx3P81067 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Irx3P81067 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
Irx3P81067 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Irx3P81067 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Irx3P81067 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Irx3P81067 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Irx3P81067 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Irx3P81067 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Irx3P81067 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Irx3P81067 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Irx3P81067 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Irx3P81067 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Irx3P81067 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Irx3P81067 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Irx3P81067 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Irx3P81067 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Irx3P81067 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Irx3P81067 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Irx3P81067 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Irx3P81067 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Irx3P81067 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Irx3P81067 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Irx3P81067 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Irx3P81067 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Irx3P81067 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Irx3P81067 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Irx3P81067 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Irx3P81067 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Irx3P81067 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Irx3P81067 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Irx3P81067 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Irx3P81067 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Irx3P81067 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Irx3P81067 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Irx3P81067 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Irx3P81067 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Irx3P81067 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Irx3P81067 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Irx3P81067 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Irx3P81067 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Irx3P81067 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Irx3P81067 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Irx3P81067 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Irx3P81067 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Irx3P81067 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Irx3P81067 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Irx3P81067 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Irx3P81067 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Irx3P81067 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Irx3P81067 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Irx3P81067 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Irx3P81067 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Irx3P81067 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Irx3P81067 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Irx3P81067 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Irx3P81067 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Irx3P81067 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Irx3P81067 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Irx3P81067 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Irx3P81067 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Irx3P81067 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Irx3P81067 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Irx3P81067 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Irx3P81067 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Irx3P81067 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Irx3P81067 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Irx3P81067 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Irx3P81067 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Irx3P81067 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Irx3P81067 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Irx3P81067 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Irx3P81067 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Irx3P81067 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Irx3P81067 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Irx3P81067 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Irx3P81067 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Irx3P81067 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Irx3P81067 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Irx3P81067 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Irx3P81067 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Irx3P81067 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms