Protein–RNA interactions for Protein: P81066

Irx2, Iroquois-class homeodomain protein IRX-2, mousemouse

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx2P81066 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Irx2P81066 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Irx2P81066 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Irx2P81066 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Irx2P81066 Timd4-201ENSMUST00000068877 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Irx2P81066 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Irx2P81066 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Irx2P81066 Gm12296-201ENSMUST00000144922 3220 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Irx2P81066 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Irx2P81066 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Irx2P81066 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Irx2P81066 Sez6l-206ENSMUST00000212758 2664 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Irx2P81066 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Irx2P81066 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Irx2P81066 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Irx2P81066 Rasal1-201ENSMUST00000031606 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Irx2P81066 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Irx2P81066 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Irx2P81066 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Irx2P81066 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Irx2P81066 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Irx2P81066 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Irx2P81066 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Irx2P81066 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Irx2P81066 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Irx2P81066 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Irx2P81066 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Irx2P81066 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Irx2P81066 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Irx2P81066 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Irx2P81066 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Irx2P81066 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Irx2P81066 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Irx2P81066 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Irx2P81066 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Irx2P81066 Pomt1-201ENSMUST00000036473 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Irx2P81066 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Irx2P81066 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Irx2P81066 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Irx2P81066 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Irx2P81066 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Irx2P81066 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Irx2P81066 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Irx2P81066 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Irx2P81066 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Irx2P81066 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Irx2P81066 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Irx2P81066 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Irx2P81066 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Irx2P81066 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Irx2P81066 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Irx2P81066 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Irx2P81066 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Irx2P81066 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Irx2P81066 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Irx2P81066 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Irx2P81066 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Irx2P81066 Pde1c-201ENSMUST00000044505 3907 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Irx2P81066 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Irx2P81066 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Irx2P81066 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Irx2P81066 Tspan18-202ENSMUST00000111265 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Irx2P81066 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Irx2P81066 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Irx2P81066 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Irx2P81066 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Irx2P81066 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Irx2P81066 Fsd2-201ENSMUST00000042318 3985 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Irx2P81066 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Irx2P81066 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Irx2P81066 Myo15b-201ENSMUST00000040703 2825 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Irx2P81066 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Irx2P81066 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Irx2P81066 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Irx2P81066 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Irx2P81066 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Irx2P81066 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Irx2P81066 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Irx2P81066 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Irx2P81066 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Irx2P81066 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Irx2P81066 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Irx2P81066 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Irx2P81066 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Irx2P81066 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Irx2P81066 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Irx2P81066 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Irx2P81066 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Irx2P81066 Tgfb1i1-201ENSMUST00000070656 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Irx2P81066 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Irx2P81066 Pla2g4c-201ENSMUST00000043612 3382 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Irx2P81066 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Irx2P81066 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Irx2P81066 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Irx2P81066 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Irx2P81066 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Irx2P81066 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Irx2P81066 Shc1-210ENSMUST00000191485 3154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Irx2P81066 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Irx2P81066 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms