Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
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