Protein–RNA interactions for Protein: P62270

Rps18, 40S ribosomal protein S18, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps18P62270 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rps18P62270 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rps18P62270 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Rps18P62270 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Rps18P62270 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Rps18P62270 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rps18P62270 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rps18P62270 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rps18P62270 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rps18P62270 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rps18P62270 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rps18P62270 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rps18P62270 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rps18P62270 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rps18P62270 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rps18P62270 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rps18P62270 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rps18P62270 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rps18P62270 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rps18P62270 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rps18P62270 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rps18P62270 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rps18P62270 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rps18P62270 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rps18P62270 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rps18P62270 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rps18P62270 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rps18P62270 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rps18P62270 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rps18P62270 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rps18P62270 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rps18P62270 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rps18P62270 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rps18P62270 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rps18P62270 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Rps18P62270 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rps18P62270 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rps18P62270 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rps18P62270 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rps18P62270 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rps18P62270 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rps18P62270 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rps18P62270 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rps18P62270 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rps18P62270 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Rps18P62270 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rps18P62270 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Rps18P62270 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rps18P62270 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rps18P62270 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rps18P62270 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rps18P62270 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rps18P62270 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rps18P62270 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rps18P62270 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rps18P62270 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rps18P62270 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rps18P62270 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rps18P62270 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rps18P62270 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rps18P62270 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rps18P62270 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rps18P62270 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rps18P62270 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rps18P62270 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Rps18P62270 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rps18P62270 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Rps18P62270 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rps18P62270 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rps18P62270 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rps18P62270 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rps18P62270 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rps18P62270 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Rps18P62270 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Rps18P62270 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rps18P62270 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Rps18P62270 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Rps18P62270 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rps18P62270 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rps18P62270 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rps18P62270 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Rps18P62270 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Rps18P62270 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Rps18P62270 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rps18P62270 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Rps18P62270 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Rps18P62270 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rps18P62270 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rps18P62270 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rps18P62270 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rps18P62270 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rps18P62270 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rps18P62270 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rps18P62270 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rps18P62270 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rps18P62270 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rps18P62270 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rps18P62270 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rps18P62270 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rps18P62270 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms