Protein–RNA interactions for Protein: P60469

Ppfia3, Liprin-alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia3P60469 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Ppfia3P60469 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ppfia3P60469 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Ppfia3P60469 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ppfia3P60469 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ppfia3P60469 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ppfia3P60469 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Ppfia3P60469 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ppfia3P60469 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ppfia3P60469 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ppfia3P60469 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ppfia3P60469 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ppfia3P60469 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Ppfia3P60469 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Ppfia3P60469 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Ppfia3P60469 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ppfia3P60469 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ppfia3P60469 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ppfia3P60469 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Ppfia3P60469 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Ppfia3P60469 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Ppfia3P60469 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Ppfia3P60469 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ppfia3P60469 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ppfia3P60469 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Ppfia3P60469 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ppfia3P60469 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ppfia3P60469 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Ppfia3P60469 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ppfia3P60469 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ppfia3P60469 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ppfia3P60469 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ppfia3P60469 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ppfia3P60469 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ppfia3P60469 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ppfia3P60469 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ppfia3P60469 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ppfia3P60469 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ppfia3P60469 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ppfia3P60469 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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