Protein–RNA interactions for Protein: P60335

Pcbp1, Poly(rC)-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcbp1P60335 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pcbp1P60335 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pcbp1P60335 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pcbp1P60335 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pcbp1P60335 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Pcbp1P60335 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pcbp1P60335 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pcbp1P60335 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pcbp1P60335 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pcbp1P60335 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pcbp1P60335 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pcbp1P60335 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pcbp1P60335 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pcbp1P60335 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pcbp1P60335 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Pcbp1P60335 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pcbp1P60335 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pcbp1P60335 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pcbp1P60335 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pcbp1P60335 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pcbp1P60335 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pcbp1P60335 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pcbp1P60335 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pcbp1P60335 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pcbp1P60335 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pcbp1P60335 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Pcbp1P60335 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Pcbp1P60335 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Pcbp1P60335 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Pcbp1P60335 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Pcbp1P60335 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Pcbp1P60335 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Pcbp1P60335 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Pcbp1P60335 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Pcbp1P60335 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Pcbp1P60335 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pcbp1P60335 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pcbp1P60335 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pcbp1P60335 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pcbp1P60335 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pcbp1P60335 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pcbp1P60335 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Pcbp1P60335 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pcbp1P60335 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Pcbp1P60335 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pcbp1P60335 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pcbp1P60335 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pcbp1P60335 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pcbp1P60335 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pcbp1P60335 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pcbp1P60335 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Pcbp1P60335 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Pcbp1P60335 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pcbp1P60335 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pcbp1P60335 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pcbp1P60335 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pcbp1P60335 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Pcbp1P60335 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pcbp1P60335 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pcbp1P60335 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pcbp1P60335 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pcbp1P60335 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pcbp1P60335 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pcbp1P60335 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pcbp1P60335 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pcbp1P60335 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pcbp1P60335 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pcbp1P60335 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Pcbp1P60335 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pcbp1P60335 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pcbp1P60335 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pcbp1P60335 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Pcbp1P60335 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pcbp1P60335 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pcbp1P60335 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pcbp1P60335 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pcbp1P60335 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pcbp1P60335 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pcbp1P60335 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pcbp1P60335 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pcbp1P60335 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pcbp1P60335 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Pcbp1P60335 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pcbp1P60335 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pcbp1P60335 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pcbp1P60335 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pcbp1P60335 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pcbp1P60335 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pcbp1P60335 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pcbp1P60335 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pcbp1P60335 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pcbp1P60335 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pcbp1P60335 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Pcbp1P60335 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pcbp1P60335 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Pcbp1P60335 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pcbp1P60335 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pcbp1P60335 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Pcbp1P60335 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pcbp1P60335 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms