Protein–RNA interactions for Protein: P59708

Sf3b6, Splicing factor 3B subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b6P59708 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Sf3b6P59708 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sf3b6P59708 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sf3b6P59708 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sf3b6P59708 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sf3b6P59708 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sf3b6P59708 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sf3b6P59708 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sf3b6P59708 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sf3b6P59708 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sf3b6P59708 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sf3b6P59708 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sf3b6P59708 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sf3b6P59708 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sf3b6P59708 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sf3b6P59708 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sf3b6P59708 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sf3b6P59708 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sf3b6P59708 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sf3b6P59708 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sf3b6P59708 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sf3b6P59708 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sf3b6P59708 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sf3b6P59708 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sf3b6P59708 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sf3b6P59708 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sf3b6P59708 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Sf3b6P59708 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sf3b6P59708 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sf3b6P59708 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sf3b6P59708 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sf3b6P59708 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sf3b6P59708 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sf3b6P59708 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sf3b6P59708 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sf3b6P59708 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sf3b6P59708 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sf3b6P59708 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Sf3b6P59708 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Sf3b6P59708 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sf3b6P59708 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sf3b6P59708 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sf3b6P59708 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sf3b6P59708 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sf3b6P59708 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sf3b6P59708 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sf3b6P59708 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sf3b6P59708 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sf3b6P59708 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sf3b6P59708 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sf3b6P59708 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.59
Sf3b6P59708 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Sf3b6P59708 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Sf3b6P59708 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.59
Sf3b6P59708 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.59
Sf3b6P59708 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sf3b6P59708 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sf3b6P59708 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sf3b6P59708 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sf3b6P59708 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sf3b6P59708 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sf3b6P59708 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sf3b6P59708 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sf3b6P59708 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sf3b6P59708 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sf3b6P59708 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sf3b6P59708 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sf3b6P59708 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sf3b6P59708 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sf3b6P59708 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Sf3b6P59708 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Sf3b6P59708 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sf3b6P59708 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sf3b6P59708 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sf3b6P59708 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sf3b6P59708 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sf3b6P59708 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Sf3b6P59708 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sf3b6P59708 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sf3b6P59708 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sf3b6P59708 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Sf3b6P59708 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sf3b6P59708 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sf3b6P59708 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sf3b6P59708 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sf3b6P59708 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sf3b6P59708 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sf3b6P59708 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sf3b6P59708 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sf3b6P59708 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sf3b6P59708 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sf3b6P59708 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sf3b6P59708 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sf3b6P59708 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sf3b6P59708 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sf3b6P59708 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sf3b6P59708 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sf3b6P59708 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Sf3b6P59708 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sf3b6P59708 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.2 ms