Protein–RNA interactions for Protein: P59242

Cgn, Cingulin, mousemouse

Predictions only

Length 1,191 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CgnP59242 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CgnP59242 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CgnP59242 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CgnP59242 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CgnP59242 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CgnP59242 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CgnP59242 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CgnP59242 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CgnP59242 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CgnP59242 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CgnP59242 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CgnP59242 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CgnP59242 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CgnP59242 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CgnP59242 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CgnP59242 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CgnP59242 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CgnP59242 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CgnP59242 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CgnP59242 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CgnP59242 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CgnP59242 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CgnP59242 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CgnP59242 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CgnP59242 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CgnP59242 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CgnP59242 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CgnP59242 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CgnP59242 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CgnP59242 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CgnP59242 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CgnP59242 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CgnP59242 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CgnP59242 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CgnP59242 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CgnP59242 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CgnP59242 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CgnP59242 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CgnP59242 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CgnP59242 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CgnP59242 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CgnP59242 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CgnP59242 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CgnP59242 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CgnP59242 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CgnP59242 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CgnP59242 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CgnP59242 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CgnP59242 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CgnP59242 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CgnP59242 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CgnP59242 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CgnP59242 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CgnP59242 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
CgnP59242 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
CgnP59242 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CgnP59242 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
CgnP59242 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CgnP59242 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CgnP59242 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CgnP59242 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CgnP59242 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CgnP59242 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CgnP59242 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CgnP59242 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CgnP59242 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CgnP59242 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CgnP59242 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CgnP59242 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CgnP59242 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CgnP59242 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CgnP59242 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CgnP59242 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CgnP59242 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CgnP59242 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CgnP59242 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CgnP59242 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CgnP59242 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CgnP59242 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CgnP59242 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CgnP59242 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CgnP59242 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CgnP59242 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CgnP59242 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CgnP59242 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CgnP59242 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CgnP59242 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CgnP59242 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CgnP59242 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CgnP59242 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CgnP59242 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CgnP59242 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CgnP59242 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CgnP59242 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CgnP59242 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CgnP59242 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CgnP59242 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CgnP59242 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CgnP59242 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CgnP59242 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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