Protein–RNA interactions for Protein: P58404

Strn4, Striatin-4, mousemouse

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Strn4P58404 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Strn4P58404 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Strn4P58404 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Strn4P58404 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Strn4P58404 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Strn4P58404 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Strn4P58404 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Strn4P58404 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Strn4P58404 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Strn4P58404 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Strn4P58404 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Strn4P58404 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Strn4P58404 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Strn4P58404 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Strn4P58404 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Strn4P58404 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Strn4P58404 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Strn4P58404 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Strn4P58404 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Strn4P58404 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Strn4P58404 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Strn4P58404 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Strn4P58404 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Strn4P58404 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Strn4P58404 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Strn4P58404 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Strn4P58404 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Strn4P58404 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Strn4P58404 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Strn4P58404 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Strn4P58404 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Strn4P58404 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Strn4P58404 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Strn4P58404 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Strn4P58404 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Strn4P58404 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Strn4P58404 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Strn4P58404 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Strn4P58404 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Strn4P58404 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Strn4P58404 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Strn4P58404 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Strn4P58404 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Strn4P58404 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Strn4P58404 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Strn4P58404 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Strn4P58404 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Strn4P58404 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Strn4P58404 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Strn4P58404 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Strn4P58404 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Strn4P58404 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Strn4P58404 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Strn4P58404 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Strn4P58404 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Strn4P58404 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Strn4P58404 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Strn4P58404 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Strn4P58404 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Strn4P58404 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Strn4P58404 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Strn4P58404 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Strn4P58404 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Strn4P58404 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Strn4P58404 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Strn4P58404 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Strn4P58404 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Strn4P58404 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Strn4P58404 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Strn4P58404 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Strn4P58404 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Strn4P58404 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Strn4P58404 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Strn4P58404 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Strn4P58404 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Strn4P58404 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Strn4P58404 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Strn4P58404 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Strn4P58404 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Strn4P58404 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Strn4P58404 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Strn4P58404 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Strn4P58404 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Strn4P58404 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Strn4P58404 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Strn4P58404 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Strn4P58404 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Strn4P58404 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Strn4P58404 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Strn4P58404 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Strn4P58404 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Strn4P58404 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Strn4P58404 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Strn4P58404 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Strn4P58404 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Strn4P58404 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Strn4P58404 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Strn4P58404 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Strn4P58404 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Strn4P58404 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms