Protein–RNA interactions for Protein: P57748

Mmp20, Matrix metalloproteinase-20, mousemouse

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Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp20P57748 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mmp20P57748 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mmp20P57748 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mmp20P57748 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mmp20P57748 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mmp20P57748 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mmp20P57748 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mmp20P57748 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mmp20P57748 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mmp20P57748 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mmp20P57748 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mmp20P57748 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mmp20P57748 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mmp20P57748 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mmp20P57748 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mmp20P57748 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mmp20P57748 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mmp20P57748 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mmp20P57748 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mmp20P57748 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mmp20P57748 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mmp20P57748 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mmp20P57748 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mmp20P57748 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mmp20P57748 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mmp20P57748 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mmp20P57748 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mmp20P57748 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mmp20P57748 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mmp20P57748 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mmp20P57748 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Mmp20P57748 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Mmp20P57748 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mmp20P57748 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mmp20P57748 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Mmp20P57748 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mmp20P57748 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mmp20P57748 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mmp20P57748 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mmp20P57748 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mmp20P57748 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mmp20P57748 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mmp20P57748 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mmp20P57748 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mmp20P57748 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mmp20P57748 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mmp20P57748 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mmp20P57748 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mmp20P57748 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mmp20P57748 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mmp20P57748 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mmp20P57748 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mmp20P57748 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mmp20P57748 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mmp20P57748 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mmp20P57748 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mmp20P57748 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mmp20P57748 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mmp20P57748 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mmp20P57748 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mmp20P57748 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mmp20P57748 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mmp20P57748 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mmp20P57748 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mmp20P57748 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mmp20P57748 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mmp20P57748 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mmp20P57748 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Mmp20P57748 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Mmp20P57748 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mmp20P57748 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mmp20P57748 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mmp20P57748 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mmp20P57748 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mmp20P57748 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mmp20P57748 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mmp20P57748 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mmp20P57748 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mmp20P57748 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mmp20P57748 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mmp20P57748 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mmp20P57748 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mmp20P57748 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mmp20P57748 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mmp20P57748 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Mmp20P57748 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mmp20P57748 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mmp20P57748 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mmp20P57748 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mmp20P57748 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mmp20P57748 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mmp20P57748 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mmp20P57748 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mmp20P57748 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Mmp20P57748 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Mmp20P57748 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mmp20P57748 Gm19891-201ENSMUST00000189771 303 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Mmp20P57748 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mmp20P57748 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Mmp20P57748 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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