Protein–RNA interactions for Protein: P56916

Gsc2, Homeobox protein goosecoid-2, mousemouse

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gsc2P56916 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gsc2P56916 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gsc2P56916 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gsc2P56916 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gsc2P56916 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gsc2P56916 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gsc2P56916 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gsc2P56916 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gsc2P56916 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Gsc2P56916 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gsc2P56916 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gsc2P56916 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gsc2P56916 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gsc2P56916 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gsc2P56916 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gsc2P56916 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gsc2P56916 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gsc2P56916 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gsc2P56916 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gsc2P56916 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gsc2P56916 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gsc2P56916 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gsc2P56916 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gsc2P56916 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gsc2P56916 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gsc2P56916 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gsc2P56916 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gsc2P56916 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gsc2P56916 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gsc2P56916 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gsc2P56916 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gsc2P56916 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Gsc2P56916 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gsc2P56916 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Gsc2P56916 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Gsc2P56916 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gsc2P56916 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gsc2P56916 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gsc2P56916 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gsc2P56916 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gsc2P56916 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gsc2P56916 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Gsc2P56916 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gsc2P56916 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gsc2P56916 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gsc2P56916 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gsc2P56916 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gsc2P56916 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gsc2P56916 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gsc2P56916 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gsc2P56916 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gsc2P56916 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gsc2P56916 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gsc2P56916 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gsc2P56916 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gsc2P56916 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gsc2P56916 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gsc2P56916 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gsc2P56916 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gsc2P56916 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gsc2P56916 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gsc2P56916 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gsc2P56916 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gsc2P56916 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gsc2P56916 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gsc2P56916 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gsc2P56916 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gsc2P56916 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
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Gsc2P56916 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gsc2P56916 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Gsc2P56916 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gsc2P56916 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gsc2P56916 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gsc2P56916 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gsc2P56916 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Gsc2P56916 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
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Gsc2P56916 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Gsc2P56916 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gsc2P56916 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Gsc2P56916 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gsc2P56916 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gsc2P56916 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gsc2P56916 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gsc2P56916 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gsc2P56916 Prl8a1-201ENSMUST00000006664 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gsc2P56916 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gsc2P56916 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gsc2P56916 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gsc2P56916 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gsc2P56916 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gsc2P56916 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gsc2P56916 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gsc2P56916 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gsc2P56916 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gsc2P56916 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gsc2P56916 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gsc2P56916 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gsc2P56916 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
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