Protein–RNA interactions for Protein: P56400

Gp1bb, Platelet glycoprotein Ib beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gp1bbP56400 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gp1bbP56400 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gp1bbP56400 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gp1bbP56400 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gp1bbP56400 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gp1bbP56400 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gp1bbP56400 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gp1bbP56400 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gp1bbP56400 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gp1bbP56400 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gp1bbP56400 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gp1bbP56400 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gp1bbP56400 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gp1bbP56400 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gp1bbP56400 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gp1bbP56400 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gp1bbP56400 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gp1bbP56400 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gp1bbP56400 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gp1bbP56400 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gp1bbP56400 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gp1bbP56400 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gp1bbP56400 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gp1bbP56400 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gp1bbP56400 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gp1bbP56400 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gp1bbP56400 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gp1bbP56400 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gp1bbP56400 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gp1bbP56400 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gp1bbP56400 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gp1bbP56400 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gp1bbP56400 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gp1bbP56400 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gp1bbP56400 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gp1bbP56400 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gp1bbP56400 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gp1bbP56400 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gp1bbP56400 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gp1bbP56400 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gp1bbP56400 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gp1bbP56400 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gp1bbP56400 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gp1bbP56400 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gp1bbP56400 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gp1bbP56400 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gp1bbP56400 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gp1bbP56400 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gp1bbP56400 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gp1bbP56400 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gp1bbP56400 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gp1bbP56400 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gp1bbP56400 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gp1bbP56400 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gp1bbP56400 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gp1bbP56400 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gp1bbP56400 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gp1bbP56400 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gp1bbP56400 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gp1bbP56400 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gp1bbP56400 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gp1bbP56400 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gp1bbP56400 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gp1bbP56400 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gp1bbP56400 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gp1bbP56400 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gp1bbP56400 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gp1bbP56400 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gp1bbP56400 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gp1bbP56400 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gp1bbP56400 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gp1bbP56400 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gp1bbP56400 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gp1bbP56400 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gp1bbP56400 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gp1bbP56400 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gp1bbP56400 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gp1bbP56400 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gp1bbP56400 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gp1bbP56400 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gp1bbP56400 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gp1bbP56400 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gp1bbP56400 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gp1bbP56400 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gp1bbP56400 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gp1bbP56400 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gp1bbP56400 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gp1bbP56400 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gp1bbP56400 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gp1bbP56400 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gp1bbP56400 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gp1bbP56400 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gp1bbP56400 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gp1bbP56400 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gp1bbP56400 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gp1bbP56400 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gp1bbP56400 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gp1bbP56400 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gp1bbP56400 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gp1bbP56400 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms