Protein–RNA interactions for Protein: P56371

Rab4a, Ras-related protein Rab-4A, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab4aP56371 Pck2-201ENSMUST00000048781 3400 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rab4aP56371 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rab4aP56371 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rab4aP56371 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rab4aP56371 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rab4aP56371 Adar-204ENSMUST00000118341 2399 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rab4aP56371 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rab4aP56371 Col5a2-201ENSMUST00000086430 6625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rab4aP56371 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rab4aP56371 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rab4aP56371 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rab4aP56371 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rab4aP56371 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rab4aP56371 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rab4aP56371 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rab4aP56371 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rab4aP56371 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rab4aP56371 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rab4aP56371 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rab4aP56371 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rab4aP56371 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rab4aP56371 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rab4aP56371 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Rab4aP56371 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rab4aP56371 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rab4aP56371 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Rab4aP56371 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rab4aP56371 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rab4aP56371 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Rab4aP56371 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rab4aP56371 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rab4aP56371 Gm8378-202ENSMUST00000167777 2624 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rab4aP56371 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rab4aP56371 Lman1-201ENSMUST00000048260 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rab4aP56371 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Rab4aP56371 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rab4aP56371 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rab4aP56371 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rab4aP56371 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rab4aP56371 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rab4aP56371 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rab4aP56371 Anxa6-202ENSMUST00000108883 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rab4aP56371 Olfr315-202ENSMUST00000203256 2458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rab4aP56371 Add2-204ENSMUST00000203366 3407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rab4aP56371 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rab4aP56371 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab4aP56371 Srpk3-201ENSMUST00000002081 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab4aP56371 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab4aP56371 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab4aP56371 Hrc-201ENSMUST00000085351 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab4aP56371 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab4aP56371 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab4aP56371 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab4aP56371 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab4aP56371 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab4aP56371 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab4aP56371 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab4aP56371 Irf9-202ENSMUST00000130697 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab4aP56371 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab4aP56371 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab4aP56371 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab4aP56371 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab4aP56371 Smad9-201ENSMUST00000029371 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab4aP56371 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab4aP56371 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab4aP56371 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab4aP56371 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab4aP56371 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab4aP56371 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
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Rab4aP56371 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab4aP56371 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab4aP56371 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab4aP56371 Slco5a1-202ENSMUST00000115403 8509 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab4aP56371 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab4aP56371 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab4aP56371 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab4aP56371 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab4aP56371 Ikbkg-204ENSMUST00000114128 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab4aP56371 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab4aP56371 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab4aP56371 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab4aP56371 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab4aP56371 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab4aP56371 4632415L05Rik-202ENSMUST00000198527 4087 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab4aP56371 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab4aP56371 Vmn1r184-207ENSMUST00000228369 6361 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab4aP56371 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab4aP56371 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab4aP56371 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab4aP56371 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab4aP56371 Hhip-201ENSMUST00000079038 9074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab4aP56371 Nfx1-203ENSMUST00000098143 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab4aP56371 Emp1-201ENSMUST00000032330 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab4aP56371 BC035947-201ENSMUST00000170511 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rab4aP56371 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rab4aP56371 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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