Protein–RNA interactions for Protein: P53808

Pctp, Phosphatidylcholine transfer protein, mousemouse

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PctpP53808 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PctpP53808 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PctpP53808 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PctpP53808 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PctpP53808 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
PctpP53808 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PctpP53808 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PctpP53808 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PctpP53808 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
PctpP53808 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PctpP53808 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PctpP53808 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PctpP53808 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
PctpP53808 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
PctpP53808 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
PctpP53808 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PctpP53808 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
PctpP53808 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
PctpP53808 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PctpP53808 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
PctpP53808 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
PctpP53808 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
PctpP53808 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PctpP53808 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PctpP53808 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
PctpP53808 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PctpP53808 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PctpP53808 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PctpP53808 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PctpP53808 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PctpP53808 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PctpP53808 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PctpP53808 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PctpP53808 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PctpP53808 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
PctpP53808 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
PctpP53808 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
PctpP53808 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
PctpP53808 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PctpP53808 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PctpP53808 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
PctpP53808 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PctpP53808 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PctpP53808 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PctpP53808 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PctpP53808 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PctpP53808 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PctpP53808 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PctpP53808 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PctpP53808 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PctpP53808 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PctpP53808 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PctpP53808 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
PctpP53808 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
PctpP53808 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PctpP53808 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PctpP53808 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PctpP53808 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PctpP53808 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PctpP53808 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
PctpP53808 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PctpP53808 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PctpP53808 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PctpP53808 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PctpP53808 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PctpP53808 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PctpP53808 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PctpP53808 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PctpP53808 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PctpP53808 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PctpP53808 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PctpP53808 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PctpP53808 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PctpP53808 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PctpP53808 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PctpP53808 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PctpP53808 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PctpP53808 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PctpP53808 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PctpP53808 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PctpP53808 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PctpP53808 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PctpP53808 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PctpP53808 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PctpP53808 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PctpP53808 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PctpP53808 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PctpP53808 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PctpP53808 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
PctpP53808 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PctpP53808 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PctpP53808 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PctpP53808 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PctpP53808 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PctpP53808 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PctpP53808 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PctpP53808 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PctpP53808 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PctpP53808 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PctpP53808 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms