Protein–RNA interactions for Protein: P52963

Epb41l4a, Band 4.1-like protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 686 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb41l4aP52963 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Epb41l4aP52963 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Epb41l4aP52963 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Epb41l4aP52963 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Epb41l4aP52963 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Epb41l4aP52963 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Epb41l4aP52963 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Epb41l4aP52963 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Epb41l4aP52963 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Epb41l4aP52963 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Epb41l4aP52963 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Epb41l4aP52963 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Epb41l4aP52963 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Epb41l4aP52963 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Epb41l4aP52963 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Epb41l4aP52963 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Epb41l4aP52963 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Epb41l4aP52963 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Epb41l4aP52963 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Epb41l4aP52963 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Epb41l4aP52963 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Epb41l4aP52963 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Epb41l4aP52963 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Epb41l4aP52963 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Epb41l4aP52963 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Epb41l4aP52963 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Epb41l4aP52963 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Epb41l4aP52963 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Epb41l4aP52963 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Epb41l4aP52963 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Epb41l4aP52963 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Epb41l4aP52963 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Epb41l4aP52963 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Epb41l4aP52963 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Epb41l4aP52963 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Epb41l4aP52963 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Epb41l4aP52963 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Epb41l4aP52963 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Epb41l4aP52963 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Epb41l4aP52963 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Epb41l4aP52963 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Epb41l4aP52963 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Epb41l4aP52963 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Epb41l4aP52963 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Epb41l4aP52963 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Epb41l4aP52963 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Epb41l4aP52963 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Epb41l4aP52963 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Epb41l4aP52963 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Epb41l4aP52963 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Epb41l4aP52963 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Epb41l4aP52963 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Epb41l4aP52963 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Epb41l4aP52963 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Epb41l4aP52963 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Epb41l4aP52963 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Epb41l4aP52963 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Epb41l4aP52963 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Epb41l4aP52963 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Epb41l4aP52963 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Epb41l4aP52963 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Epb41l4aP52963 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Epb41l4aP52963 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Epb41l4aP52963 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Epb41l4aP52963 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Epb41l4aP52963 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Epb41l4aP52963 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Epb41l4aP52963 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Epb41l4aP52963 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Epb41l4aP52963 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Epb41l4aP52963 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Epb41l4aP52963 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Epb41l4aP52963 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Epb41l4aP52963 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Epb41l4aP52963 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Epb41l4aP52963 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Epb41l4aP52963 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Epb41l4aP52963 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Epb41l4aP52963 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Epb41l4aP52963 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Epb41l4aP52963 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Epb41l4aP52963 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Epb41l4aP52963 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Epb41l4aP52963 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Epb41l4aP52963 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Epb41l4aP52963 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Epb41l4aP52963 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Epb41l4aP52963 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Epb41l4aP52963 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Epb41l4aP52963 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Epb41l4aP52963 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Epb41l4aP52963 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Epb41l4aP52963 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Epb41l4aP52963 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Epb41l4aP52963 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Epb41l4aP52963 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Epb41l4aP52963 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Epb41l4aP52963 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Epb41l4aP52963 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Epb41l4aP52963 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.6 ms