Protein–RNA interactions for Protein: P49452

Cenpc, Centromere protein C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpcP49452 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CenpcP49452 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CenpcP49452 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CenpcP49452 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CenpcP49452 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CenpcP49452 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CenpcP49452 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CenpcP49452 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CenpcP49452 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC13□□□□□ -0.33
CenpcP49452 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CenpcP49452 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CenpcP49452 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CenpcP49452 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CenpcP49452 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CenpcP49452 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CenpcP49452 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CenpcP49452 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CenpcP49452 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC13□□□□□ -0.33
CenpcP49452 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CenpcP49452 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CenpcP49452 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CenpcP49452 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CenpcP49452 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CenpcP49452 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CenpcP49452 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CenpcP49452 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CenpcP49452 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CenpcP49452 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CenpcP49452 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CenpcP49452 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CenpcP49452 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
CenpcP49452 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
CenpcP49452 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC13□□□□□ -0.33
CenpcP49452 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CenpcP49452 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
CenpcP49452 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CenpcP49452 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CenpcP49452 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CenpcP49452 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CenpcP49452 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC13□□□□□ -0.33
CenpcP49452 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CenpcP49452 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CenpcP49452 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC13□□□□□ -0.33
CenpcP49452 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CenpcP49452 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
CenpcP49452 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CenpcP49452 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CenpcP49452 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CenpcP49452 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
CenpcP49452 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CenpcP49452 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CenpcP49452 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CenpcP49452 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CenpcP49452 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CenpcP49452 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
CenpcP49452 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CenpcP49452 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CenpcP49452 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CenpcP49452 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CenpcP49452 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CenpcP49452 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CenpcP49452 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CenpcP49452 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
CenpcP49452 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CenpcP49452 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
CenpcP49452 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
CenpcP49452 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CenpcP49452 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CenpcP49452 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CenpcP49452 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CenpcP49452 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
CenpcP49452 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CenpcP49452 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CenpcP49452 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CenpcP49452 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CenpcP49452 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CenpcP49452 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CenpcP49452 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CenpcP49452 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CenpcP49452 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CenpcP49452 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
CenpcP49452 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CenpcP49452 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CenpcP49452 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CenpcP49452 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CenpcP49452 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
CenpcP49452 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CenpcP49452 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CenpcP49452 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
CenpcP49452 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CenpcP49452 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CenpcP49452 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
CenpcP49452 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CenpcP49452 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CenpcP49452 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CenpcP49452 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
CenpcP49452 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
CenpcP49452 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CenpcP49452 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CenpcP49452 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms