Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
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PtpreP49446 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PtpreP49446 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
PtpreP49446 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PtpreP49446 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
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PtpreP49446 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PtpreP49446 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
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PtpreP49446 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PtpreP49446 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
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PtpreP49446 4933405E24Rik-201ENSMUST00000131019 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
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PtpreP49446 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
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PtpreP49446 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
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PtpreP49446 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
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PtpreP49446 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PtpreP49446 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
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PtpreP49446 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PtpreP49446 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
PtpreP49446 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
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PtpreP49446 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
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PtpreP49446 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
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PtpreP49446 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
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PtpreP49446 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PtpreP49446 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PtpreP49446 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PtpreP49446 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PtpreP49446 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PtpreP49446 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PtpreP49446 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PtpreP49446 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PtpreP49446 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PtpreP49446 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PtpreP49446 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PtpreP49446 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PtpreP49446 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PtpreP49446 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PtpreP49446 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PtpreP49446 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PtpreP49446 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PtpreP49446 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PtpreP49446 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PtpreP49446 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PtpreP49446 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PtpreP49446 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PtpreP49446 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PtpreP49446 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PtpreP49446 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
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