Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

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Length 269 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SrprbP47758 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SrprbP47758 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SrprbP47758 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SrprbP47758 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SrprbP47758 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SrprbP47758 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SrprbP47758 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SrprbP47758 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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SrprbP47758 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SrprbP47758 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
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SrprbP47758 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SrprbP47758 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SrprbP47758 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SrprbP47758 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SrprbP47758 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SrprbP47758 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SrprbP47758 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SrprbP47758 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SrprbP47758 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SrprbP47758 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SrprbP47758 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SrprbP47758 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SrprbP47758 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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SrprbP47758 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SrprbP47758 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SrprbP47758 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SrprbP47758 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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SrprbP47758 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SrprbP47758 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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SrprbP47758 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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SrprbP47758 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SrprbP47758 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SrprbP47758 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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SrprbP47758 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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SrprbP47758 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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SrprbP47758 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SrprbP47758 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SrprbP47758 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SrprbP47758 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SrprbP47758 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SrprbP47758 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SrprbP47758 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SrprbP47758 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SrprbP47758 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SrprbP47758 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SrprbP47758 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SrprbP47758 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SrprbP47758 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SrprbP47758 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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SrprbP47758 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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