Protein–RNA interactions for Protein: P41274

Tnfsf9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf9P41274 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tnfsf9P41274 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tnfsf9P41274 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tnfsf9P41274 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tnfsf9P41274 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tnfsf9P41274 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tnfsf9P41274 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tnfsf9P41274 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tnfsf9P41274 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tnfsf9P41274 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tnfsf9P41274 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tnfsf9P41274 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tnfsf9P41274 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tnfsf9P41274 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tnfsf9P41274 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tnfsf9P41274 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tnfsf9P41274 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tnfsf9P41274 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tnfsf9P41274 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tnfsf9P41274 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tnfsf9P41274 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tnfsf9P41274 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tnfsf9P41274 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tnfsf9P41274 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tnfsf9P41274 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tnfsf9P41274 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tnfsf9P41274 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Tnfsf9P41274 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Tnfsf9P41274 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tnfsf9P41274 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tnfsf9P41274 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tnfsf9P41274 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tnfsf9P41274 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tnfsf9P41274 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tnfsf9P41274 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tnfsf9P41274 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Tnfsf9P41274 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Tnfsf9P41274 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tnfsf9P41274 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tnfsf9P41274 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tnfsf9P41274 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tnfsf9P41274 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tnfsf9P41274 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tnfsf9P41274 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tnfsf9P41274 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tnfsf9P41274 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tnfsf9P41274 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tnfsf9P41274 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tnfsf9P41274 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tnfsf9P41274 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tnfsf9P41274 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tnfsf9P41274 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tnfsf9P41274 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tnfsf9P41274 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tnfsf9P41274 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tnfsf9P41274 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tnfsf9P41274 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tnfsf9P41274 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tnfsf9P41274 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tnfsf9P41274 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tnfsf9P41274 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tnfsf9P41274 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tnfsf9P41274 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tnfsf9P41274 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tnfsf9P41274 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Tnfsf9P41274 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tnfsf9P41274 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tnfsf9P41274 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tnfsf9P41274 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tnfsf9P41274 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tnfsf9P41274 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Tnfsf9P41274 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Tnfsf9P41274 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tnfsf9P41274 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Tnfsf9P41274 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tnfsf9P41274 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tnfsf9P41274 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tnfsf9P41274 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tnfsf9P41274 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tnfsf9P41274 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tnfsf9P41274 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tnfsf9P41274 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tnfsf9P41274 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tnfsf9P41274 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tnfsf9P41274 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tnfsf9P41274 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tnfsf9P41274 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tnfsf9P41274 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tnfsf9P41274 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tnfsf9P41274 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tnfsf9P41274 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tnfsf9P41274 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tnfsf9P41274 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tnfsf9P41274 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tnfsf9P41274 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tnfsf9P41274 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Tnfsf9P41274 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tnfsf9P41274 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tnfsf9P41274 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tnfsf9P41274 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms