Protein–RNA interactions for Protein: P41245

Mmp9, Matrix metalloproteinase-9, mousemouse

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Length 730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp9P41245 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Gm3139-202ENSMUST00000201138 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Gm3183-203ENSMUST00000202911 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mmp9P41245 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
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