Protein–RNA interactions for Protein: P41155

Ltb, Lymphotoxin-beta, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbP41155 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LtbP41155 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LtbP41155 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LtbP41155 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
LtbP41155 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LtbP41155 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LtbP41155 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LtbP41155 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LtbP41155 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
LtbP41155 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LtbP41155 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
LtbP41155 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LtbP41155 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
LtbP41155 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
LtbP41155 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
LtbP41155 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LtbP41155 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
LtbP41155 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
LtbP41155 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LtbP41155 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
LtbP41155 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LtbP41155 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
LtbP41155 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
LtbP41155 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LtbP41155 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
LtbP41155 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
LtbP41155 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
LtbP41155 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
LtbP41155 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
LtbP41155 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LtbP41155 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LtbP41155 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
LtbP41155 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LtbP41155 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LtbP41155 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LtbP41155 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
LtbP41155 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
LtbP41155 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LtbP41155 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
LtbP41155 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
LtbP41155 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LtbP41155 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LtbP41155 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
LtbP41155 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LtbP41155 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
LtbP41155 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LtbP41155 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LtbP41155 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LtbP41155 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
LtbP41155 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LtbP41155 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LtbP41155 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
LtbP41155 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
LtbP41155 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
LtbP41155 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
LtbP41155 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
LtbP41155 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
LtbP41155 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
LtbP41155 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
LtbP41155 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
LtbP41155 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
LtbP41155 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
LtbP41155 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
LtbP41155 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
LtbP41155 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
LtbP41155 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
LtbP41155 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
LtbP41155 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
LtbP41155 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
LtbP41155 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
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LtbP41155 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
LtbP41155 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
LtbP41155 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
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LtbP41155 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
LtbP41155 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
LtbP41155 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
LtbP41155 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
LtbP41155 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
LtbP41155 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
LtbP41155 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
LtbP41155 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
LtbP41155 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
LtbP41155 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
LtbP41155 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
LtbP41155 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
LtbP41155 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
LtbP41155 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
LtbP41155 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
LtbP41155 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
LtbP41155 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
LtbP41155 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
LtbP41155 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
LtbP41155 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
LtbP41155 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
LtbP41155 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
LtbP41155 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
LtbP41155 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
LtbP41155 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
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