Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC8.6□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC8.6□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC8.6□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC8.6□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.6□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC8.6□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC8.6□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC8.6□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.6□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.6□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Rpl28P41105 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.04
Rpl28P41105 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.04
Rpl28P41105 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.04
Rpl28P41105 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.04
Rpl28P41105 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Rpl28P41105 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
Rpl28P41105 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC8.58□□□□□ -1.04
Rpl28P41105 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Rpl28P41105 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
Rpl28P41105 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
Rpl28P41105 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Rpl28P41105 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Rpl28P41105 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
Rpl28P41105 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Rpl28P41105 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
Rpl28P41105 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Rpl28P41105 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Rpl28P41105 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Rpl28P41105 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Rpl28P41105 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Rpl28P41105 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Rpl28P41105 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
Rpl28P41105 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
Rpl28P41105 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
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