Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Hoxc11P31313 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Hoxc11P31313 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Hoxc11P31313 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Hoxc11P31313 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Hoxc11P31313 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Hoxc11P31313 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Hoxc11P31313 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Hoxc11P31313 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Hoxc11P31313 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Hoxc11P31313 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Hoxc11P31313 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Hoxc11P31313 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Hoxc11P31313 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Hoxc11P31313 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Hoxc11P31313 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Hoxc11P31313 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Hoxc11P31313 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Hoxc11P31313 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Hoxc11P31313 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Hoxc11P31313 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Hoxc11P31313 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Hoxc11P31313 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Hoxc11P31313 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Hoxc11P31313 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Hoxc11P31313 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Hoxc11P31313 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Hoxc11P31313 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Hoxc11P31313 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Hoxc11P31313 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Hoxc11P31313 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Hoxc11P31313 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Hoxc11P31313 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Hoxc11P31313 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Hoxc11P31313 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Hoxc11P31313 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Hoxc11P31313 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Hoxc11P31313 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Hoxc11P31313 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Hoxc11P31313 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Hoxc11P31313 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Hoxc11P31313 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Hoxc11P31313 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Hoxc11P31313 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Hoxc11P31313 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Hoxc11P31313 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Hoxc11P31313 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Hoxc11P31313 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Hoxc11P31313 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Hoxc11P31313 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Hoxc11P31313 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Hoxc11P31313 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Hoxc11P31313 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Hoxc11P31313 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Hoxc11P31313 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Hoxc11P31313 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Hoxc11P31313 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Hoxc11P31313 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Hoxc11P31313 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Hoxc11P31313 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Hoxc11P31313 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Hoxc11P31313 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Hoxc11P31313 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Hoxc11P31313 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Hoxc11P31313 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Hoxc11P31313 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Hoxc11P31313 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Hoxc11P31313 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Hoxc11P31313 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Hoxc11P31313 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Hoxc11P31313 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Hoxc11P31313 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Hoxc11P31313 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxc11P31313 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxc11P31313 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxc11P31313 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxc11P31313 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxc11P31313 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxc11P31313 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxc11P31313 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxc11P31313 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxc11P31313 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxc11P31313 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxc11P31313 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxc11P31313 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxc11P31313 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxc11P31313 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxc11P31313 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxc11P31313 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxc11P31313 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxc11P31313 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxc11P31313 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxc11P31313 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxc11P31313 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxc11P31313 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxc11P31313 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxc11P31313 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxc11P31313 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxc11P31313 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxc11P31313 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms