Protein–RNA interactions for Protein: P31245

Hoxa2, Homeobox protein Hox-A2, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa2P31245 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 AC156952.1-201ENSMUST00000220361 793 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 4930456G14Rik-201ENSMUST00000193054 1330 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Gm5605-201ENSMUST00000208940 1305 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Gm20275-201ENSMUST00000215963 1387 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Olfr812-201ENSMUST00000057775 1043 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Odaph-201ENSMUST00000178614 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Gm8480-201ENSMUST00000190350 698 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxa2P31245 Gm45078-201ENSMUST00000205343 546 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms