Protein–RNA interactions for Protein: P26339

Chga, Chromogranin-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChgaP26339 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ChgaP26339 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ChgaP26339 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ChgaP26339 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ChgaP26339 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ChgaP26339 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ChgaP26339 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ChgaP26339 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ChgaP26339 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ChgaP26339 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ChgaP26339 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ChgaP26339 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ChgaP26339 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ChgaP26339 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ChgaP26339 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ChgaP26339 2810403D21Rik-207ENSMUST00000152089 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ChgaP26339 Gm12718-202ENSMUST00000156144 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ChgaP26339 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ChgaP26339 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ChgaP26339 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ChgaP26339 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ChgaP26339 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ChgaP26339 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ChgaP26339 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ChgaP26339 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ChgaP26339 AC154828.2-201ENSMUST00000220908 1070 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ChgaP26339 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ChgaP26339 AC165260.5-201ENSMUST00000224640 1247 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ChgaP26339 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ChgaP26339 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ChgaP26339 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ChgaP26339 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ChgaP26339 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ChgaP26339 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ChgaP26339 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ChgaP26339 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ChgaP26339 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ChgaP26339 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ChgaP26339 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ChgaP26339 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ChgaP26339 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ChgaP26339 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ChgaP26339 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ChgaP26339 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ChgaP26339 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ChgaP26339 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ChgaP26339 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ChgaP26339 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ChgaP26339 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ChgaP26339 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ChgaP26339 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ChgaP26339 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ChgaP26339 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ChgaP26339 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ChgaP26339 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ChgaP26339 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ChgaP26339 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ChgaP26339 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ChgaP26339 Gm40645-202ENSMUST00000219828 874 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ChgaP26339 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ChgaP26339 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ChgaP26339 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ChgaP26339 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ChgaP26339 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ChgaP26339 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ChgaP26339 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ChgaP26339 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ChgaP26339 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ChgaP26339 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ChgaP26339 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ChgaP26339 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ChgaP26339 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ChgaP26339 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ChgaP26339 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ChgaP26339 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ChgaP26339 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ChgaP26339 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ChgaP26339 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ChgaP26339 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ChgaP26339 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ChgaP26339 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ChgaP26339 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ChgaP26339 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ChgaP26339 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ChgaP26339 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ChgaP26339 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ChgaP26339 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ChgaP26339 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ChgaP26339 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ChgaP26339 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ChgaP26339 Gm27231-201ENSMUST00000185191 551 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ChgaP26339 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ChgaP26339 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ChgaP26339 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ChgaP26339 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ChgaP26339 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ChgaP26339 Gm44953-201ENSMUST00000208745 1286 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ChgaP26339 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ChgaP26339 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ChgaP26339 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms