Protein–RNA interactions for Protein: P25233

Ndn, Necdin, mousemouse

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Length 325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NdnP25233 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
NdnP25233 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
NdnP25233 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
NdnP25233 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
NdnP25233 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
NdnP25233 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
NdnP25233 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
NdnP25233 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
NdnP25233 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
NdnP25233 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
NdnP25233 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
NdnP25233 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
NdnP25233 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
NdnP25233 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
NdnP25233 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
NdnP25233 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
NdnP25233 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
NdnP25233 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
NdnP25233 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
NdnP25233 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
NdnP25233 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
NdnP25233 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
NdnP25233 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
NdnP25233 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
NdnP25233 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
NdnP25233 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
NdnP25233 4732490B19Rik-201ENSMUST00000130373 2446 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
NdnP25233 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
NdnP25233 Slc10a6-201ENSMUST00000031263 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
NdnP25233 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
NdnP25233 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
NdnP25233 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
NdnP25233 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
NdnP25233 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
NdnP25233 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
NdnP25233 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
NdnP25233 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
NdnP25233 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
NdnP25233 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
NdnP25233 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
NdnP25233 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
NdnP25233 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
NdnP25233 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
NdnP25233 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
NdnP25233 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
NdnP25233 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
NdnP25233 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
NdnP25233 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
NdnP25233 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
NdnP25233 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
NdnP25233 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
NdnP25233 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
NdnP25233 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
NdnP25233 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
NdnP25233 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
NdnP25233 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
NdnP25233 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
NdnP25233 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
NdnP25233 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
NdnP25233 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
NdnP25233 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
NdnP25233 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
NdnP25233 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
NdnP25233 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
NdnP25233 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
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NdnP25233 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
NdnP25233 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
NdnP25233 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
NdnP25233 Gm45828-201ENSMUST00000206938 1836 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
NdnP25233 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
NdnP25233 Snx31-203ENSMUST00000161202 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
NdnP25233 Abca2-201ENSMUST00000102919 8033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
NdnP25233 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
NdnP25233 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
NdnP25233 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
NdnP25233 Gaa-201ENSMUST00000026666 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
NdnP25233 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
NdnP25233 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
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NdnP25233 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
NdnP25233 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
NdnP25233 Flicr-201ENSMUST00000144719 3455 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
NdnP25233 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
NdnP25233 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
NdnP25233 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
NdnP25233 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
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NdnP25233 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
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NdnP25233 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
NdnP25233 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
NdnP25233 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms