Protein–RNA interactions for Protein: P24699

Myf5, Myogenic factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myf5P24699 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Myf5P24699 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Myf5P24699 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Myf5P24699 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Myf5P24699 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Myf5P24699 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Myf5P24699 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Myf5P24699 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Myf5P24699 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Myf5P24699 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Myf5P24699 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Myf5P24699 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Myf5P24699 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Myf5P24699 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Myf5P24699 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Myf5P24699 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Myf5P24699 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Myf5P24699 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Myf5P24699 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Myf5P24699 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Myf5P24699 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Myf5P24699 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Myf5P24699 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Myf5P24699 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Myf5P24699 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Myf5P24699 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Myf5P24699 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Myf5P24699 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Myf5P24699 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Myf5P24699 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Myf5P24699 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Myf5P24699 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Myf5P24699 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Myf5P24699 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Myf5P24699 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Myf5P24699 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Myf5P24699 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Myf5P24699 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Myf5P24699 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Myf5P24699 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Myf5P24699 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Myf5P24699 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Myf5P24699 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Myf5P24699 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Myf5P24699 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Myf5P24699 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Myf5P24699 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Myf5P24699 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Myf5P24699 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Myf5P24699 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Myf5P24699 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Myf5P24699 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Myf5P24699 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Myf5P24699 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Myf5P24699 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Myf5P24699 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Myf5P24699 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
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Myf5P24699 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Myf5P24699 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Myf5P24699 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Myf5P24699 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Myf5P24699 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Myf5P24699 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Myf5P24699 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Myf5P24699 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Myf5P24699 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Myf5P24699 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Myf5P24699 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Myf5P24699 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Myf5P24699 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Myf5P24699 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Myf5P24699 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Myf5P24699 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Myf5P24699 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC12.21□□□□□ -0.46
Myf5P24699 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Myf5P24699 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Myf5P24699 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Myf5P24699 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Myf5P24699 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Myf5P24699 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Myf5P24699 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Myf5P24699 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Myf5P24699 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Myf5P24699 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Myf5P24699 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Myf5P24699 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Myf5P24699 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Myf5P24699 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Myf5P24699 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Myf5P24699 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Myf5P24699 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Myf5P24699 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Myf5P24699 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Myf5P24699 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Myf5P24699 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Myf5P24699 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Myf5P24699 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Myf5P24699 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Myf5P24699 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.4 ms