Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

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Length 394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Ggta1P23336 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Ggta1P23336 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ggta1P23336 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Ggta1P23336 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ggta1P23336 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
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Ggta1P23336 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
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Ggta1P23336 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ggta1P23336 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
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Ggta1P23336 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ggta1P23336 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ggta1P23336 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ggta1P23336 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ggta1P23336 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ggta1P23336 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ggta1P23336 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ggta1P23336 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ggta1P23336 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ggta1P23336 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ggta1P23336 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ggta1P23336 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ggta1P23336 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Ggta1P23336 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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