Protein–RNA interactions for Protein: P20334

Tnfrsf9, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 9, mousemouse

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Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf9P20334 Gm38115-201ENSMUST00000194317 2413 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfrsf9P20334 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfrsf9P20334 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfrsf9P20334 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfrsf9P20334 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfrsf9P20334 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfrsf9P20334 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfrsf9P20334 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfrsf9P20334 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfrsf9P20334 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfrsf9P20334 9430065F17Rik-202ENSMUST00000180908 1084 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfrsf9P20334 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfrsf9P20334 Gm19331-201ENSMUST00000193799 1092 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfrsf9P20334 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfrsf9P20334 Gm31831-201ENSMUST00000196240 684 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfrsf9P20334 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfrsf9P20334 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfrsf9P20334 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfrsf9P20334 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfrsf9P20334 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfrsf9P20334 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfrsf9P20334 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfrsf9P20334 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfrsf9P20334 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfrsf9P20334 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfrsf9P20334 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfrsf9P20334 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfrsf9P20334 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfrsf9P20334 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfrsf9P20334 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfrsf9P20334 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfrsf9P20334 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfrsf9P20334 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfrsf9P20334 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfrsf9P20334 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfrsf9P20334 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfrsf9P20334 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfrsf9P20334 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfrsf9P20334 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfrsf9P20334 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfrsf9P20334 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfrsf9P20334 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnfrsf9P20334 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnfrsf9P20334 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnfrsf9P20334 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnfrsf9P20334 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnfrsf9P20334 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnfrsf9P20334 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnfrsf9P20334 Lrtm1-203ENSMUST00000224760 3060 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnfrsf9P20334 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnfrsf9P20334 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnfrsf9P20334 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnfrsf9P20334 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnfrsf9P20334 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnfrsf9P20334 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnfrsf9P20334 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnfrsf9P20334 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnfrsf9P20334 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnfrsf9P20334 4732490B19Rik-201ENSMUST00000130373 2446 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnfrsf9P20334 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnfrsf9P20334 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnfrsf9P20334 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnfrsf9P20334 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Tnfrsf9P20334 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnfrsf9P20334 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnfrsf9P20334 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnfrsf9P20334 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnfrsf9P20334 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnfrsf9P20334 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnfrsf9P20334 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnfrsf9P20334 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnfrsf9P20334 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnfrsf9P20334 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnfrsf9P20334 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnfrsf9P20334 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnfrsf9P20334 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnfrsf9P20334 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnfrsf9P20334 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnfrsf9P20334 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnfrsf9P20334 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnfrsf9P20334 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnfrsf9P20334 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnfrsf9P20334 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnfrsf9P20334 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnfrsf9P20334 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnfrsf9P20334 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnfrsf9P20334 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnfrsf9P20334 Tmem130-201ENSMUST00000061446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnfrsf9P20334 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tnfrsf9P20334 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tnfrsf9P20334 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tnfrsf9P20334 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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