Protein–RNA interactions for Protein: P20293

T, Brachyury protein, mousemouse

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Length 436 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP20293 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TP20293 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TP20293 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TP20293 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TP20293 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TP20293 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TP20293 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
TP20293 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TP20293 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TP20293 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TP20293 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TP20293 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TP20293 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
TP20293 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
TP20293 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
TP20293 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
TP20293 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TP20293 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TP20293 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TP20293 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TP20293 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TP20293 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TP20293 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TP20293 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TP20293 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
TP20293 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TP20293 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TP20293 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TP20293 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TP20293 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TP20293 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TP20293 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TP20293 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TP20293 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TP20293 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TP20293 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TP20293 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TP20293 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TP20293 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TP20293 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TP20293 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TP20293 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TP20293 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TP20293 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TP20293 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TP20293 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TP20293 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TP20293 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TP20293 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TP20293 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TP20293 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TP20293 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TP20293 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TP20293 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
TP20293 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TP20293 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TP20293 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TP20293 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TP20293 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TP20293 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TP20293 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TP20293 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
TP20293 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
TP20293 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TP20293 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TP20293 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TP20293 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TP20293 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TP20293 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TP20293 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TP20293 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TP20293 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TP20293 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TP20293 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TP20293 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
TP20293 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
TP20293 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TP20293 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TP20293 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TP20293 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TP20293 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TP20293 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TP20293 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TP20293 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TP20293 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TP20293 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
TP20293 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TP20293 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TP20293 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TP20293 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
TP20293 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TP20293 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
TP20293 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TP20293 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TP20293 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TP20293 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TP20293 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TP20293 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TP20293 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TP20293 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
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