Protein–RNA interactions for Protein: P19123

Tnnc1, Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc1P19123 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Tnnc1P19123 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Tnnc1P19123 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Tnnc1P19123 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Tnnc1P19123 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Tnnc1P19123 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tnnc1P19123 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tnnc1P19123 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tnnc1P19123 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tnnc1P19123 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tnnc1P19123 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tnnc1P19123 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tnnc1P19123 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tnnc1P19123 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tnnc1P19123 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tnnc1P19123 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tnnc1P19123 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tnnc1P19123 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tnnc1P19123 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Tnnc1P19123 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tnnc1P19123 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tnnc1P19123 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tnnc1P19123 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tnnc1P19123 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tnnc1P19123 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tnnc1P19123 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tnnc1P19123 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Tnnc1P19123 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Tnnc1P19123 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tnnc1P19123 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tnnc1P19123 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tnnc1P19123 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tnnc1P19123 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tnnc1P19123 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tnnc1P19123 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tnnc1P19123 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tnnc1P19123 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tnnc1P19123 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tnnc1P19123 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tnnc1P19123 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tnnc1P19123 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tnnc1P19123 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tnnc1P19123 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tnnc1P19123 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tnnc1P19123 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tnnc1P19123 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tnnc1P19123 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tnnc1P19123 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Tnnc1P19123 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Tnnc1P19123 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Tnnc1P19123 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tnnc1P19123 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tnnc1P19123 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tnnc1P19123 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Tnnc1P19123 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tnnc1P19123 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tnnc1P19123 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tnnc1P19123 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tnnc1P19123 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tnnc1P19123 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tnnc1P19123 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tnnc1P19123 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tnnc1P19123 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tnnc1P19123 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tnnc1P19123 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tnnc1P19123 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tnnc1P19123 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tnnc1P19123 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tnnc1P19123 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Tnnc1P19123 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tnnc1P19123 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tnnc1P19123 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tnnc1P19123 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tnnc1P19123 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tnnc1P19123 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tnnc1P19123 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Tnnc1P19123 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tnnc1P19123 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tnnc1P19123 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tnnc1P19123 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tnnc1P19123 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tnnc1P19123 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tnnc1P19123 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tnnc1P19123 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tnnc1P19123 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tnnc1P19123 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tnnc1P19123 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Tnnc1P19123 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Tnnc1P19123 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Tnnc1P19123 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tnnc1P19123 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tnnc1P19123 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Tnnc1P19123 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tnnc1P19123 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tnnc1P19123 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tnnc1P19123 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tnnc1P19123 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Tnnc1P19123 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tnnc1P19123 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tnnc1P19123 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms