Protein–RNA interactions for Protein: P18530

Ig heavy chain V region 7-39, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18530 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
P18530 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
P18530 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
P18530 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
P18530 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
P18530 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
P18530 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
P18530 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
P18530 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
P18530 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
P18530 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
P18530 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
P18530 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
P18530 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
P18530 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
P18530 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
P18530 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
P18530 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
P18530 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
P18530 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
P18530 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
P18530 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
P18530 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
P18530 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
P18530 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
P18530 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
P18530 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
P18530 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
P18530 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
P18530 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
P18530 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
P18530 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
P18530 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
P18530 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
P18530 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
P18530 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
P18530 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
P18530 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
P18530 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
P18530 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
P18530 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
P18530 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
P18530 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
P18530 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
P18530 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
P18530 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
P18530 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
P18530 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
P18530 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
P18530 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
P18530 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
P18530 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
P18530 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
P18530 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
P18530 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
P18530 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
P18530 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
P18530 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
P18530 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
P18530 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
P18530 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
P18530 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
P18530 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
P18530 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
P18530 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
P18530 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
P18530 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
P18530 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
P18530 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
P18530 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
P18530 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
P18530 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
P18530 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
P18530 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
P18530 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
P18530 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
P18530 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
P18530 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
P18530 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
P18530 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
P18530 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
P18530 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
P18530 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
P18530 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
P18530 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
P18530 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
P18530 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
P18530 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
P18530 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
P18530 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
P18530 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
P18530 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
P18530 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
P18530 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
P18530 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
P18530 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
P18530 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
P18530 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
P18530 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
P18530 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms