Protein–RNA interactions for Protein: P18052

Ptpra, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, mousemouse

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Length 829 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpraP18052 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PtpraP18052 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
PtpraP18052 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PtpraP18052 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PtpraP18052 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PtpraP18052 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PtpraP18052 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
PtpraP18052 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC14.41□□□□□ -0.1
PtpraP18052 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PtpraP18052 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PtpraP18052 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PtpraP18052 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PtpraP18052 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PtpraP18052 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PtpraP18052 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PtpraP18052 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
PtpraP18052 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PtpraP18052 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PtpraP18052 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
PtpraP18052 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PtpraP18052 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PtpraP18052 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PtpraP18052 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PtpraP18052 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PtpraP18052 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
PtpraP18052 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PtpraP18052 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
PtpraP18052 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
PtpraP18052 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PtpraP18052 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
PtpraP18052 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
PtpraP18052 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
PtpraP18052 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
PtpraP18052 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
PtpraP18052 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
PtpraP18052 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
PtpraP18052 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC14.4□□□□□ -0.1
PtpraP18052 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PtpraP18052 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PtpraP18052 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
PtpraP18052 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PtpraP18052 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
PtpraP18052 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
PtpraP18052 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PtpraP18052 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
PtpraP18052 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC14.4□□□□□ -0.11
PtpraP18052 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PtpraP18052 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PtpraP18052 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PtpraP18052 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PtpraP18052 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PtpraP18052 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PtpraP18052 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PtpraP18052 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PtpraP18052 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
PtpraP18052 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PtpraP18052 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PtpraP18052 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PtpraP18052 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
PtpraP18052 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PtpraP18052 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
PtpraP18052 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
PtpraP18052 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
PtpraP18052 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PtpraP18052 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PtpraP18052 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PtpraP18052 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PtpraP18052 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PtpraP18052 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PtpraP18052 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
PtpraP18052 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
PtpraP18052 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PtpraP18052 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PtpraP18052 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PtpraP18052 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PtpraP18052 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PtpraP18052 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PtpraP18052 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PtpraP18052 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PtpraP18052 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PtpraP18052 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PtpraP18052 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PtpraP18052 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PtpraP18052 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
PtpraP18052 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
PtpraP18052 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PtpraP18052 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PtpraP18052 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PtpraP18052 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PtpraP18052 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
PtpraP18052 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PtpraP18052 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PtpraP18052 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PtpraP18052 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PtpraP18052 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PtpraP18052 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PtpraP18052 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PtpraP18052 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PtpraP18052 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PtpraP18052 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
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