Protein–RNA interactions for Protein: P14733

Lmnb1, Lamin-B1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmnb1P14733 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmnb1P14733 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmnb1P14733 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmnb1P14733 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmnb1P14733 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmnb1P14733 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmnb1P14733 Adap2os-201ENSMUST00000140556 984 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmnb1P14733 Rsph14-206ENSMUST00000166088 1203 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmnb1P14733 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmnb1P14733 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmnb1P14733 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmnb1P14733 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmnb1P14733 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmnb1P14733 Rps18-ps3-201ENSMUST00000080443 456 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmnb1P14733 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmnb1P14733 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmnb1P14733 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmnb1P14733 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmnb1P14733 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmnb1P14733 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmnb1P14733 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmnb1P14733 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmnb1P14733 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmnb1P14733 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmnb1P14733 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmnb1P14733 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmnb1P14733 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmnb1P14733 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmnb1P14733 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmnb1P14733 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmnb1P14733 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmnb1P14733 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmnb1P14733 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmnb1P14733 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmnb1P14733 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmnb1P14733 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmnb1P14733 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmnb1P14733 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmnb1P14733 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmnb1P14733 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmnb1P14733 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmnb1P14733 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmnb1P14733 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmnb1P14733 Gm25880-201ENSMUST00000104331 132 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmnb1P14733 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmnb1P14733 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmnb1P14733 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmnb1P14733 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmnb1P14733 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmnb1P14733 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmnb1P14733 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmnb1P14733 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmnb1P14733 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmnb1P14733 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmnb1P14733 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmnb1P14733 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmnb1P14733 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmnb1P14733 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmnb1P14733 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmnb1P14733 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmnb1P14733 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lmnb1P14733 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lmnb1P14733 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lmnb1P14733 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lmnb1P14733 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lmnb1P14733 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lmnb1P14733 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lmnb1P14733 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lmnb1P14733 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lmnb1P14733 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Lmnb1P14733 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lmnb1P14733 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lmnb1P14733 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lmnb1P14733 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lmnb1P14733 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lmnb1P14733 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lmnb1P14733 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lmnb1P14733 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lmnb1P14733 Prss46-201ENSMUST00000119427 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lmnb1P14733 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lmnb1P14733 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lmnb1P14733 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lmnb1P14733 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lmnb1P14733 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lmnb1P14733 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Lmnb1P14733 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Lmnb1P14733 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lmnb1P14733 Prrxl1-205ENSMUST00000228878 723 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Lmnb1P14733 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lmnb1P14733 Gm9873-201ENSMUST00000063891 1097 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Lmnb1P14733 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lmnb1P14733 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lmnb1P14733 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lmnb1P14733 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lmnb1P14733 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lmnb1P14733 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lmnb1P14733 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lmnb1P14733 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lmnb1P14733 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lmnb1P14733 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms