Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 Gm29179-208ENSMUST00000190450 1137 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hoxd4P10628 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.6 ms