Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P10404 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
P10404 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
P10404 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P10404 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P10404 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
P10404 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
P10404 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
P10404 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
P10404 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
P10404 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
P10404 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
P10404 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
P10404 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P10404 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
P10404 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
P10404 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
P10404 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
P10404 Gm8369-204ENSMUST00000188633 1227 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
P10404 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
P10404 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
P10404 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
P10404 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
P10404 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P10404 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P10404 Olfr173-201ENSMUST00000049940 1164 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
P10404 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
P10404 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P10404 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
P10404 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P10404 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P10404 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P10404 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
P10404 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P10404 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P10404 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P10404 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
P10404 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P10404 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P10404 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P10404 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P10404 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P10404 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P10404 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P10404 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
P10404 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P10404 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P10404 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P10404 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P10404 Gm38116-201ENSMUST00000193873 1533 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
P10404 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
P10404 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
P10404 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
P10404 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
P10404 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
P10404 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
P10404 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
P10404 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
P10404 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
P10404 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
P10404 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
P10404 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
P10404 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
P10404 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
P10404 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
P10404 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
P10404 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
P10404 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
P10404 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
P10404 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
P10404 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
P10404 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
P10404 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
P10404 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
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P10404 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
P10404 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
P10404 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
P10404 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
P10404 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
P10404 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
P10404 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
P10404 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
P10404 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
P10404 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
P10404 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
P10404 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
P10404 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
P10404 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
P10404 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
P10404 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
P10404 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
P10404 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
P10404 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
P10404 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
P10404 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
P10404 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
P10404 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
P10404 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
P10404 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
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