Protein–RNA interactions for Protein: P09021

Hoxa5, Homeobox protein Hox-A5, mousemouse

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa5P09021 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 Gm18515-201ENSMUST00000219755 797 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 Ccl11-201ENSMUST00000000342 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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