Protein–RNA interactions for Protein: P08032

Spta1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spta1P08032 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Spta1P08032 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Spta1P08032 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Spta1P08032 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Spta1P08032 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Spta1P08032 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Spta1P08032 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Spta1P08032 Rasl11a-201ENSMUST00000031646 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Spta1P08032 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Spta1P08032 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Spta1P08032 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Spta1P08032 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Spta1P08032 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Spta1P08032 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Spta1P08032 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Spta1P08032 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Spta1P08032 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Spta1P08032 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Spta1P08032 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Spta1P08032 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Spta1P08032 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Spta1P08032 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Spta1P08032 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Spta1P08032 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Spta1P08032 Ywhaq-ps2-201ENSMUST00000117738 643 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Spta1P08032 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Spta1P08032 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Spta1P08032 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Spta1P08032 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Spta1P08032 Gm28324-201ENSMUST00000187913 264 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Spta1P08032 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Spta1P08032 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Spta1P08032 Psmd12-202ENSMUST00000106750 1311 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Spta1P08032 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Spta1P08032 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Spta1P08032 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Spta1P08032 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Spta1P08032 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Spta1P08032 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Spta1P08032 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Spta1P08032 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Spta1P08032 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Spta1P08032 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Spta1P08032 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Spta1P08032 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
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Spta1P08032 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Spta1P08032 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Spta1P08032 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Spta1P08032 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Spta1P08032 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Spta1P08032 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Spta1P08032 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Spta1P08032 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Spta1P08032 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Spta1P08032 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Spta1P08032 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Spta1P08032 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Spta1P08032 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Spta1P08032 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Spta1P08032 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Spta1P08032 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Spta1P08032 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Spta1P08032 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Spta1P08032 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
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Spta1P08032 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
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Spta1P08032 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
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Spta1P08032 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Spta1P08032 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Spta1P08032 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Spta1P08032 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Spta1P08032 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Spta1P08032 Gm8325-201ENSMUST00000099086 453 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Spta1P08032 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Spta1P08032 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Spta1P08032 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Spta1P08032 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Spta1P08032 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Spta1P08032 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Spta1P08032 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Spta1P08032 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Spta1P08032 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Spta1P08032 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Spta1P08032 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Spta1P08032 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Spta1P08032 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Spta1P08032 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Spta1P08032 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Spta1P08032 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Spta1P08032 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Spta1P08032 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Spta1P08032 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Spta1P08032 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Spta1P08032 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
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