Protein–RNA interactions for Protein: P04919

Slc4a1, Band 3 anion transport protein, mousemouse

Predictions only

Length 929 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc4a1P04919 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc4a1P04919 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc4a1P04919 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc4a1P04919 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc4a1P04919 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc4a1P04919 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc4a1P04919 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc4a1P04919 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc4a1P04919 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc4a1P04919 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc4a1P04919 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc4a1P04919 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc4a1P04919 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc4a1P04919 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc4a1P04919 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc4a1P04919 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc4a1P04919 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc4a1P04919 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc4a1P04919 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc4a1P04919 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc4a1P04919 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc4a1P04919 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc4a1P04919 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc4a1P04919 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc4a1P04919 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc4a1P04919 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc4a1P04919 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc4a1P04919 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc4a1P04919 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc4a1P04919 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc4a1P04919 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc4a1P04919 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc4a1P04919 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc4a1P04919 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc4a1P04919 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc4a1P04919 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc4a1P04919 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc4a1P04919 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc4a1P04919 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc4a1P04919 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc4a1P04919 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc4a1P04919 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc4a1P04919 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc4a1P04919 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc4a1P04919 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc4a1P04919 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc4a1P04919 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc4a1P04919 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc4a1P04919 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc4a1P04919 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc4a1P04919 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc4a1P04919 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc4a1P04919 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc4a1P04919 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc4a1P04919 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc4a1P04919 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc4a1P04919 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc4a1P04919 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc4a1P04919 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc4a1P04919 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc4a1P04919 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc4a1P04919 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc4a1P04919 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc4a1P04919 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc4a1P04919 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc4a1P04919 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc4a1P04919 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc4a1P04919 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc4a1P04919 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc4a1P04919 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc4a1P04919 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc4a1P04919 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc4a1P04919 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc4a1P04919 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc4a1P04919 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc4a1P04919 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc4a1P04919 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc4a1P04919 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc4a1P04919 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc4a1P04919 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc4a1P04919 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc4a1P04919 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc4a1P04919 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc4a1P04919 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc4a1P04919 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc4a1P04919 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc4a1P04919 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc4a1P04919 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc4a1P04919 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc4a1P04919 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc4a1P04919 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc4a1P04919 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc4a1P04919 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc4a1P04919 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc4a1P04919 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc4a1P04919 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc4a1P04919 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc4a1P04919 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc4a1P04919 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc4a1P04919 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms