Protein–RNA interactions for Protein: P01649

Ig kappa chain V-V regions, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01649 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P01649 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P01649 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P01649 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P01649 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
P01649 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
P01649 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P01649 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P01649 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P01649 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P01649 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
P01649 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
P01649 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
P01649 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P01649 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
P01649 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
P01649 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
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P01649 Gm28707-201ENSMUST00000186134 558 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
P01649 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
P01649 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
P01649 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
P01649 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
P01649 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
P01649 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
P01649 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
P01649 AC114573.1-201ENSMUST00000224120 1210 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
P01649 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P01649 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
P01649 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P01649 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
P01649 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P01649 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
P01649 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
P01649 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P01649 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
P01649 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P01649 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P01649 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P01649 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P01649 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
P01649 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P01649 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P01649 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P01649 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P01649 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P01649 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
P01649 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P01649 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P01649 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P01649 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P01649 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
P01649 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P01649 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P01649 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P01649 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P01649 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
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P01649 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
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P01649 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
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P01649 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P01649 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P01649 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P01649 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P01649 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P01649 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
P01649 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
P01649 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P01649 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
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P01649 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
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P01649 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
P01649 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
P01649 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
P01649 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
P01649 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
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