Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccl20O89093 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccl20O89093 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccl20O89093 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccl20O89093 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccl20O89093 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccl20O89093 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccl20O89093 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccl20O89093 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccl20O89093 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccl20O89093 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccl20O89093 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccl20O89093 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccl20O89093 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccl20O89093 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccl20O89093 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccl20O89093 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Ccl20O89093 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Ccl20O89093 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Ccl20O89093 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC11.15□□□□□ -0.63
Ccl20O89093 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Ccl20O89093 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Ccl20O89093 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Ccl20O89093 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Ccl20O89093 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccl20O89093 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccl20O89093 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccl20O89093 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccl20O89093 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccl20O89093 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccl20O89093 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccl20O89093 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccl20O89093 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccl20O89093 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccl20O89093 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccl20O89093 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccl20O89093 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccl20O89093 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccl20O89093 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccl20O89093 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccl20O89093 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccl20O89093 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccl20O89093 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccl20O89093 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccl20O89093 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccl20O89093 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccl20O89093 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccl20O89093 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccl20O89093 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccl20O89093 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccl20O89093 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccl20O89093 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccl20O89093 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccl20O89093 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccl20O89093 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccl20O89093 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccl20O89093 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccl20O89093 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccl20O89093 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccl20O89093 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccl20O89093 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccl20O89093 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccl20O89093 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccl20O89093 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccl20O89093 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
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Ccl20O89093 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccl20O89093 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccl20O89093 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccl20O89093 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccl20O89093 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccl20O89093 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccl20O89093 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccl20O89093 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccl20O89093 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccl20O89093 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccl20O89093 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccl20O89093 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccl20O89093 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccl20O89093 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccl20O89093 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccl20O89093 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccl20O89093 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccl20O89093 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccl20O89093 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccl20O89093 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccl20O89093 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccl20O89093 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccl20O89093 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccl20O89093 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccl20O89093 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccl20O89093 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccl20O89093 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccl20O89093 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccl20O89093 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccl20O89093 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccl20O89093 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccl20O89093 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccl20O89093 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccl20O89093 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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