Protein–RNA interactions for Protein: O88574

Sap30, Histone deacetylase complex subunit SAP30, mousemouse

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Length 220 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sap30O88574 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Sap30O88574 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Sap30O88574 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Sap30O88574 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sap30O88574 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Sap30O88574 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sap30O88574 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Sap30O88574 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Sap30O88574 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sap30O88574 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sap30O88574 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Sap30O88574 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Sap30O88574 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sap30O88574 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sap30O88574 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sap30O88574 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sap30O88574 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Sap30O88574 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Sap30O88574 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Sap30O88574 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sap30O88574 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Sap30O88574 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Sap30O88574 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sap30O88574 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Sap30O88574 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sap30O88574 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sap30O88574 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sap30O88574 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sap30O88574 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sap30O88574 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Sap30O88574 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC10□□□□□ -0.81
Sap30O88574 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Sap30O88574 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sap30O88574 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sap30O88574 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sap30O88574 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Sap30O88574 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Sap30O88574 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sap30O88574 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Sap30O88574 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sap30O88574 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sap30O88574 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sap30O88574 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Sap30O88574 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sap30O88574 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sap30O88574 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sap30O88574 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sap30O88574 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sap30O88574 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sap30O88574 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sap30O88574 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Sap30O88574 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sap30O88574 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sap30O88574 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sap30O88574 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sap30O88574 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Sap30O88574 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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Sap30O88574 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sap30O88574 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
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Sap30O88574 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sap30O88574 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sap30O88574 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
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Sap30O88574 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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Sap30O88574 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sap30O88574 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sap30O88574 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sap30O88574 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sap30O88574 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sap30O88574 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sap30O88574 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sap30O88574 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sap30O88574 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sap30O88574 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sap30O88574 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sap30O88574 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sap30O88574 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sap30O88574 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Sap30O88574 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sap30O88574 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sap30O88574 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sap30O88574 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sap30O88574 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sap30O88574 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sap30O88574 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sap30O88574 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sap30O88574 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sap30O88574 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sap30O88574 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Sap30O88574 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
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