Protein–RNA interactions for Protein: O88545

Cops6, COP9 signalosome complex subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops6O88545 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cops6O88545 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cops6O88545 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cops6O88545 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cops6O88545 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cops6O88545 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cops6O88545 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cops6O88545 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cops6O88545 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cops6O88545 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cops6O88545 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cops6O88545 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cops6O88545 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cops6O88545 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cops6O88545 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cops6O88545 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cops6O88545 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cops6O88545 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cops6O88545 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cops6O88545 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cops6O88545 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cops6O88545 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cops6O88545 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cops6O88545 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cops6O88545 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cops6O88545 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cops6O88545 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cops6O88545 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cops6O88545 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cops6O88545 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cops6O88545 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cops6O88545 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cops6O88545 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cops6O88545 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cops6O88545 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cops6O88545 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cops6O88545 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cops6O88545 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cops6O88545 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cops6O88545 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cops6O88545 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cops6O88545 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cops6O88545 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cops6O88545 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cops6O88545 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cops6O88545 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cops6O88545 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cops6O88545 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cops6O88545 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cops6O88545 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cops6O88545 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cops6O88545 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cops6O88545 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cops6O88545 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cops6O88545 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cops6O88545 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cops6O88545 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cops6O88545 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cops6O88545 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cops6O88545 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cops6O88545 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cops6O88545 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cops6O88545 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cops6O88545 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cops6O88545 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cops6O88545 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cops6O88545 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cops6O88545 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cops6O88545 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cops6O88545 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cops6O88545 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cops6O88545 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cops6O88545 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cops6O88545 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cops6O88545 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cops6O88545 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cops6O88545 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cops6O88545 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cops6O88545 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cops6O88545 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cops6O88545 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cops6O88545 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cops6O88545 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cops6O88545 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cops6O88545 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cops6O88545 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cops6O88545 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cops6O88545 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cops6O88545 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cops6O88545 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cops6O88545 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cops6O88545 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cops6O88545 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cops6O88545 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cops6O88545 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cops6O88545 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cops6O88545 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cops6O88545 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cops6O88545 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cops6O88545 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.6 ms